近50年來，臺灣已經完成二個版次的臺灣植物誌的編輯工作，因而研究人員對於本地植物相已有較充足之瞭解。自2008至2010年，特有生物研究保育中心與臺灣植物分類學會合作展開臺灣維管束植物紅皮書之評估工作，依據世界保育聯盟紅皮書等級與準則3.1 版(IUCN 2001)與世界保育聯盟紅皮書等級地區性指引(IUCN 2003; 圖一)，共同評估了4,701個臺灣維管束植物種類，並於2012年出版《臺灣維管束植物紅皮書初評名錄》，該書由王震哲、邱文良、張和明負責編輯，許再文、郭長生、彭鏡毅、楊國禎、劉和義和謝長富擔任編輯委員。
　　結果顯示有908種為族群生存受威脅之物種(即CR、EN 及VU)，佔適用評估物種之21.78%，而統計結果顯示，特有物種面臨較高的生存威脅，即1,063種特有物種中有324種(30.48%)為受威脅物種。缺乏族群資料或分類未明之物種數比例接近7%(DD)，顯示部分物種的仍存在族群監測資料缺乏及分類學問題，專家學者仍須獲取更多資料才足以作完整評估。
　　評估結果可以提升受威脅維管束植物的保育關注度，然造成這些物種族群下降的因素，如野生植物採集、入侵植物威脅與城市擴展等依然存在，因此亟需儘快透過立法提供嚴重瀕危物種最低限度的保護，並進行受威脅與優先保育物種的保育缺失區分析(conservation gap analysis)，確保這些物種受到積極原地與移地保育，以期遏止生物多樣性流失，同時保存其遺傳多樣性。

　　依據臺灣淡水魚類名錄總整理的結果，扣除外來種累計淡水及河口魚類，台灣至少有58科265種的原生淡水魚類，其中包含許多臺灣特有種魚類，然而近年來由於棲地受到人為工程及開發的干擾與破壞，以及外來種的攻擊及競爭，使得許多台灣淡水魚類物種陷入瀕危的狀態。2008年中華民國魚類學會接受林務局委託，進行為期三年的「臺灣地區淡水域湖泊、野塘及溪流魚類現況調查及保育研究規劃」計畫，經過許多專家學者及評審委員的共同討論，評定出52種淡水魚類並出版《臺灣淡水魚類紅皮書》。書中包含有10種已公告的「國家級保育類淡水魚種」，以及初次收錄的42種「其他具瀕危風險之淡水魚種」。該書分成兩節，分別說明紅皮書收錄的各種淡水魚知詳細現況及資訊，作者為陳義雄、曾晴賢及邵廣昭。
　　該書依據IUCN評定標準及我國野生動物保護法評析臺灣原生淡水魚類之受脅評估等級，其標準如下：

• 極危Critically endangered(CR)：某一物種在很短時間內，在野外有面臨滅絕的高度危險，且被認定為極危物種。該書登錄3種。
• 瀕危Endangered (EN)：當某一物種未達到極危標準，但可能在不久的未來，在野外有瀕臨滅絕的危機時，且被認定為瀕危物種。該書登錄3種。
• 易危Vulnerable (VU)：某一物種雖未達到極危或瀕危的標準，但在一個相當長的時間內，在野外會面臨滅絕的危險，且被認定為易危物種。該書登錄15種。
• 接近受脅Near Threatened (NT)：某一物種經過準則的評估後，無法合於極危、瀕危、易危的等級，但已很接近易危等級或是未來可能達到受脅等級。該書登錄31種
• 較少受威脅Least Concern (LC)：某一物種經過準則評估後無法合於極危、瀕危、易危及接近受脅等級，分布廣、數量多的物種屬於這個等級。該書未登錄。