農委會與海委會公告保育類物種收錄 297 種         
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脊索動物門哺乳綱Artiodactyla偶蹄目Bovidae牛科Capricornis swinhoei 臺灣野山羊.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門哺乳綱Artiodactyla偶蹄目Cervidae鹿科Rusa unicolor swinhoii 臺灣水鹿.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
節肢動物門軟甲綱Decapoda十足目Coenobitidae陸寄居蟹科Birgus latro 椰子蟹 農委會公告珍貴稀有野生動物 
節肢動物門昆蟲綱Hemiptera半翅目Cicadidae蟬科Formotosena seebohmi 臺灣爺蟬.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門哺乳綱Rodentia嚙齒目Muridae鼠科Micromys minutus 巢鼠 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門兩生綱Caudata有尾目Hynobiidae山椒魚科Hynobius arisanensis 阿里山山椒魚 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門兩生綱Caudata有尾目Hynobiidae山椒魚科Hynobius formosanus 臺灣山椒魚.. 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門兩生綱Caudata有尾目Hynobiidae山椒魚科Hynobius fuca 觀霧山椒魚 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門兩生綱Caudata有尾目Hynobiidae山椒魚科Hynobius glacialis 南湖山椒魚 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門兩生綱Caudata有尾目Hynobiidae山椒魚科Hynobius sonani 楚南氏山椒魚 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Squamata有鱗目Gekkonidae壁虎科Gekko kikuchii 菊池氏壁虎.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Squamata有鱗目Gekkonidae壁虎科Lepidodactylus yami 雅美鱗趾虎.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Squamata有鱗目Lacertidae正蜥科Takydromus sauteri 梭德氏草蜥.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Squamata有鱗目Homalopsidae水蛇科Enhydris plumbea 鉛色水蛇.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Squamata有鱗目Homalopsidae水蛇科Myrrophis chinensis 唐水蛇.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Squamata有鱗目Anguidae蛇蜥科Dopasia harti 哈特氏蛇蜥.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Squamata有鱗目Elapidae蝙蝠蛇科Naja atra 眼鏡蛇.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Squamata有鱗目Elapidae蝙蝠蛇科Sinomicrurus hatori 羽鳥氏帶紋赤蛇.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Squamata有鱗目Elapidae蝙蝠蛇科Sinomicrurus macclellandi swinhoei 環紋赤蛇.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Squamata有鱗目Elapidae蝙蝠蛇科Sinomicrurus sauteri 梭德氏帶紋赤蛇.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 

本表說明:農、海委會名錄包括全球範圍,國際物種部分參考華盛頓公約(CITES)第15、16次會員大會最新附錄修正。本表為其中TaiCoL資料庫已收錄的物種,包括依據野生動物保育法公告之陸海域野生保育類、依據文資保存法公告之珍貴稀有植物、依據漁業法公告禁止捕撈販賣及持有之水產動植物。
行政院農委會保育類野生動物名錄曾於103年7月2日、106年5月1日、108年1月9日調整,珍貴稀有植物於108年4月23日亦有更動。海委會109年4月28日公告修正海洋保育類野生動物名錄。