農委會與海委會公告保育類物種收錄 297 種         
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脊索動物門爬蟲綱Squamata有鱗目Homalopsidae水蛇科Myrrophis chinensis 唐水蛇.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Squamata有鱗目Elapidae蝙蝠蛇科Naja atra 眼鏡蛇.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門哺乳綱Carnivora食肉目Felidae貓科Neofelis nebulosa brachyura 臺灣雲豹.. 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門哺乳綱Cetacea鯨目Phocoenidae鼠海豚科Neophocaena phocaenoides 江豚.. 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門鳥綱Passeriformes雀形目Muscicapidae鶲科Niltava vivida vivida 黃腹琉璃.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門鳥綱Strigiformes鴞形目Strigidae鴟鴞科Ninox japonica japonica 褐鷹鴞(過境亞種).. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Strigiformes鴞形目Strigidae鴟鴞科Ninox japonica totogo 褐鷹鴞(留鳥亞種).. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Pelecaniformes鵜形目Threskiornithidae䴉科Nipponia nippon 朱鷺.. 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門鳥綱Accipitriformes鷹形目Accipitridae鷹科Nisaetus nipalensis nipalensis 熊鷹.. 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門鳥綱Charadriiformes鴴形目Scolopacidae鷸科Numenius arquata orientalis 大杓鷸.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門鳥綱Charadriiformes鴴形目Scolopacidae鷸科Numenius madagascariensis 黦鷸.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門條鰭魚綱Salmoniformes鮭形目Salmonidae鮭科Oncorhynchus masou formosanus 臺灣櫻花鉤吻鮭.. 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門鳥綱Charadriiformes鴴形目Laridae鷗科Onychoprion anaethetus anaethetus 白眉燕鷗 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門哺乳綱Cetacea鯨目Delphinidae海豚科Orcinus orca 虎鯨 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Passeriformes雀形目Oriolidae黃鸝科Oriolus chinensis diffusus 黃鸝.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Passeriformes雀形目Oriolidae黃鸝科Oriolus traillii ardens 朱鸝 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Squamata有鱗目Colubridae黃頷蛇科Orthriophis taeniurus friesi 臺灣黑眉錦蛇.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門鳥綱Strigiformes鴞形目Strigidae鴟鴞科Otus elegans botelensis 蘭嶼角鴞.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Strigiformes鴞形目Strigidae鴟鴞科Otus lettia erythrocampe 領角鴞(華南亞種).. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Strigiformes鴞形目Strigidae鴟鴞科Otus lettia glabripes 領角鴞(台灣亞種).. 農委會公告珍貴稀有野生動物 

本表說明:農、海委會名錄包括全球範圍,國際物種部分參考華盛頓公約(CITES)第15、16次會員大會最新附錄修正。本表為其中TaiCoL資料庫已收錄的物種,包括依據野生動物保育法公告之陸海域野生保育類、依據文資保存法公告之珍貴稀有植物、依據漁業法公告禁止捕撈販賣及持有之水產動植物。
行政院農委會保育類野生動物名錄曾於103年7月2日、106年5月1日、108年1月9日調整,珍貴稀有植物於108年4月23日亦有更動。海委會109年4月28日公告修正海洋保育類野生動物名錄。