農委會與海委會公告保育類物種收錄 297 種         
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脊索動物門鳥綱Pelecaniformes鵜形目Threskiornithidae䴉科Threskiornis melanocephalus 黑頭白鹮 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Columbiformes鴿形目Columbidae鳩鴿科Treron formosae formosae 紅頭綠鳩(台灣亞種).. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Squamata有鱗目Viperidae蝮蛇科Trimeresurus gracilis 菊池氏龜殼花.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門鳥綱Charadriiformes鴴形目Scolopacidae鷸科Tringa guttifer 諾氏鷸.. 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
節肢動物門昆蟲綱Lepidoptera鱗翅目Papilionidae鳳蝶科Troides aeacus kaguya 黃裳鳳蝶.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
節肢動物門昆蟲綱Lepidoptera鱗翅目Papilionidae鳳蝶科Troides magellanus sonani 珠光裳鳳蝶.. 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門鳥綱Passeriformes雀形目Turdidae鶇科Turdus niveiceps 白頭鶇.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Charadriiformes鴴形目Turnicidae三趾鶉科Turnix sylvaticus davidi 林三趾鶉.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門哺乳綱Cetacea鯨目Delphinidae海豚科Tursiops aduncus 印太瓶鼻海豚 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門哺乳綱Cetacea鯨目Delphinidae海豚科Tursiops truncatus 瓶鼻海豚 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Strigiformes鴞形目Tytonidae草鴞科Tyto longimembris pithecops 草鴞.. 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門鳥綱Passeriformes雀形目Corvidae鴉科Urocissa caerulea 臺灣藍鵲.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門哺乳綱Carnivora食肉目Ursidae熊科Ursus thibetanus formosanus 臺灣黑熊.. 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門哺乳綱Carnivora食肉目Viverridae靈貓科Viverricula indica taivana 麝香貓.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Squamata有鱗目Colubridae黃頷蛇科Xenochrophis flavipunctatus 草花蛇 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門鳥綱Passeriformes雀形目Zosteropidae繡眼科Yuhina brunneiceps 冠羽畫眉.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門哺乳綱Cetacea鯨目Ziphiidae喙鯨科Ziphius cavirostris 柯氏喙鯨 農委會公告珍貴稀有野生動物 

本表說明:農、海委會名錄包括全球範圍,國際物種部分參考華盛頓公約(CITES)第15、16次會員大會最新附錄修正。本表為其中TaiCoL資料庫已收錄的物種,包括依據野生動物保育法公告之陸海域野生保育類、依據文資保存法公告之珍貴稀有植物、依據漁業法公告禁止捕撈販賣及持有之水產動植物。
行政院農委會保育類野生動物名錄曾於103年7月2日、106年5月1日、108年1月9日調整,珍貴稀有植物於108年4月23日亦有更動。海委會109年4月28日公告修正海洋保育類野生動物名錄。