農委會與海委會公告保育類物種收錄 297 種         
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脊索動物門鳥綱Gruiformes鶴形目Gruidae鶴科Antigone vipio 白枕鶴.. 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
節肢動物門昆蟲綱Coleoptera鞘翅目Lampyridae螢科Aquatica hydrophila 黃胸黑翅螢 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Accipitriformes鷹形目Accipitridae鷹科Aquila fasciata fasciata 白腹鵰.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Accipitriformes鷹形目Accipitridae鷹科Aquila heliaca 白肩鵰 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門鳥綱Psittaciformes鸚形目Psittacidae鸚鵡科Ara ararauna 琉璃金剛鸚鵡.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Galliformes雞形目Phasianidae雉科Arborophila crudigularis 臺灣山鷓鴣.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門鳥綱Strigiformes鴞形目Strigidae鴟鴞科Asio flammeus flammeus 短耳鴞.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Strigiformes鴞形目Strigidae鴟鴞科Asio otus otus 長耳鴞.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Strigiformes鴞形目Strigidae鴟鴞科Athene noctua plumipes 縱紋腹小鴞 農委會公告珍貴稀有野生動物 
節肢動物門昆蟲綱Lepidoptera鱗翅目Papilionidae鳳蝶科Atrophaneura horishana 曙鳳蝶.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門鳥綱Accipitriformes鷹形目Accipitridae鷹科Aviceda leuphotes syama 黑冠鵑隼 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Anseriformes雁形目Anatidae雁鴨科Aythya baeri 青頭潛鴨 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門兩生綱Anura無尾目Ranidae赤蛙科Babina okinavana 豎琴蛙 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門哺乳綱Cetacea鯨目Balaenopteridae鬚鯨科Balaenoptera acutorostrata 小鬚鯨 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門哺乳綱Cetacea鯨目Balaenopteridae鬚鯨科Balaenoptera borealis 鰮鯨 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門哺乳綱Cetacea鯨目Balaenopteridae鬚鯨科Balaenoptera edeni 鯷鯨 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門哺乳綱Cetacea鯨目Balaenopteridae鬚鯨科Balaenoptera edeni brydei 布氏鯨 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門哺乳綱Cetacea鯨目Balaenopteridae鬚鯨科Balaenoptera musculus 藍鯨 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門哺乳綱Cetacea鯨目Balaenopteridae鬚鯨科Balaenoptera omurai 大村鯨 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門哺乳綱Cetacea鯨目Balaenopteridae鬚鯨科Balaenoptera physalus 長須鯨 農委會公告瀕臨絕種野生動物 

本表說明:農、海委會名錄包括全球範圍,國際物種部分參考華盛頓公約(CITES)第15、16次會員大會最新附錄修正。本表為其中TaiCoL資料庫已收錄的物種,包括依據野生動物保育法公告之陸海域野生保育類、依據文資保存法公告之珍貴稀有植物、依據漁業法公告禁止捕撈販賣及持有之水產動植物。
行政院農委會保育類野生動物名錄曾於103年7月2日、106年5月1日、108年1月9日調整,珍貴稀有植物於108年4月23日亦有更動。海委會109年4月28日公告修正海洋保育類野生動物名錄。