農委會與海委會公告保育類物種收錄 297 種         
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脊索動物門鳥綱Passeriformes雀形目Estrildidae梅花雀科Lonchura atricapilla formosana 黑頭文鳥(台灣原生亞種).. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門鳥綱Passeriformes雀形目Estrildidae梅花雀科Lonchura atricapilla sinensis 栗腹文鳥(馬來亞種).. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
維管束植物門木蘭綱Fagales殼斗目Fagaceae殼斗科Fagus hayatae 臺灣水青岡.. 農委會公告珍貴稀有植物 
脊索動物門鳥綱Falconiformes隼形目Falconidae隼科Falco amurensis 紅腳隼.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Falconiformes隼形目Falconidae隼科Falco columbarius insignis 灰背隼(普通亞種).. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Falconiformes隼形目Falconidae隼科Falco columbarius pacificus 灰背隼(太平洋亞種).. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Falconiformes隼形目Falconidae隼科Falco naumanni 黃爪隼 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Falconiformes隼形目Falconidae隼科Falco peregrinus calidus 遊隼(花梨隼).. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Falconiformes隼形目Falconidae隼科Falco peregrinus ernesti 遊隼(菲律賓亞種).. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Falconiformes隼形目Falconidae隼科Falco peregrinus japonensis 遊隼(日本亞種).. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Falconiformes隼形目Falconidae隼科Falco peregrinus peregrinator 遊隼(赤胸隼).. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Falconiformes隼形目Falconidae隼科Falco subbuteo streichi 燕隼(南方亞種).. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Falconiformes隼形目Falconidae隼科Falco subbuteo subbuteo 燕隼(指名亞種).. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Falconiformes隼形目Falconidae隼科Falco tinnunculus interstinctus 紅隼(普通亞種).. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Falconiformes隼形目Falconidae隼科Falco tinnunculus tinnunculus 紅隼(指名亞種).. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門哺乳綱Carnivora食肉目Felidae貓科Neofelis nebulosa brachyura 臺灣雲豹.. 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門哺乳綱Carnivora食肉目Felidae貓科Prionailurus bengalensis 石虎.. 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門鳥綱Passeriformes雀形目Fringillidae雀科Carpodacus formosanus 臺灣朱雀.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Squamata有鱗目Gekkonidae壁虎科Gekko kikuchii 菊池氏壁虎.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Squamata有鱗目Gekkonidae壁虎科Lepidodactylus yami 雅美鱗趾虎.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 

本表說明:農、海委會名錄包括全球範圍,國際物種部分參考華盛頓公約(CITES)第15、16次會員大會最新附錄修正。本表為其中TaiCoL資料庫已收錄的物種,包括依據野生動物保育法公告之陸海域野生保育類、依據文資保存法公告之珍貴稀有植物、依據漁業法公告禁止捕撈販賣及持有之水產動植物。
行政院農委會保育類野生動物名錄曾於103年7月2日、106年5月1日、108年1月9日調整,珍貴稀有植物於108年4月23日亦有更動。海委會109年4月28日公告修正海洋保育類野生動物名錄。