農委會與海委會公告保育類物種收錄 297 種         
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脊索動物門哺乳綱Cetacea鯨目Ziphiidae喙鯨科Indopacetus pacificus 朗氏喙鯨 農委會公告珍貴稀有野生動物 
維管束植物門松綱Cupressales柏目Cupressaceae柏科Juniperus chinensis taiwanensis 清水圓柏 農委會公告珍貴稀有植物 
脊索動物門鳥綱Strigiformes鴞形目Strigidae鴟鴞科Ketupa flavipes 黃魚鴞 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門哺乳綱Cetacea鯨目Kogiidae小抹香鯨科Kogia breviceps 小抹香鯨 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門哺乳綱Cetacea鯨目Kogiidae小抹香鯨科Kogia sima 侏儒抹香鯨 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門哺乳綱Cetacea鯨目Delphinidae海豚科Lagenodelphis hosei 弗氏海豚 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Passeriformes雀形目Laniidae伯勞科Lanius cristatus cristatus 紅尾伯勞(指名亞種).. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門鳥綱Passeriformes雀形目Leiothrichidae噪眉科Leiothrix argentauris 銀耳相思鳥.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Passeriformes雀形目Leiothrichidae噪眉科Leiothrix lutea 紅嘴相思鳥.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Testudines龜鱉目Cheloniidae蠵龜科Lepidochelys olivacea 欖蠵龜.. 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Squamata有鱗目Gekkonidae壁虎科Lepidodactylus yami 雅美鱗趾虎.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Gruiformes鶴形目Gruidae鶴科Leucogeranus leucogeranus 白鶴.. 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門鳥綱Charadriiformes鴴形目Scolopacidae鷸科Limnodromus semipalmatus 半蹼鷸 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門鳥綱Charadriiformes鴴形目Scolopacidae鷸科Limosa limosa melanuroides 黑尾鷸.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門條鰭魚綱Siluriformes鯰形目Amblycipitidae鈍頭鮠科Liobagrus formosanus 臺灣䱀.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門鳥綱Passeriformes雀形目Leiothrichidae噪眉科Liocichla steerii 黃胸藪眉.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門鳥綱Passeriformes雀形目Estrildidae梅花雀科Lonchura atricapilla formosana 黑頭文鳥(台灣原生亞種).. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門鳥綱Passeriformes雀形目Estrildidae梅花雀科Lonchura atricapilla sinensis 栗腹文鳥(馬來亞種).. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門鳥綱Galliformes雞形目Phasianidae雉科Lophura swinhoii 藍腹鷴.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門哺乳綱Carnivora食肉目Mustelidae貂科Lutra lutra chinensis 水獺.. 農委會公告瀕臨絕種野生動物 

本表說明:農、海委會名錄包括全球範圍,國際物種部分參考華盛頓公約(CITES)第15、16次會員大會最新附錄修正。本表為其中TaiCoL資料庫已收錄的物種,包括依據野生動物保育法公告之陸海域野生保育類、依據文資保存法公告之珍貴稀有植物、依據漁業法公告禁止捕撈販賣及持有之水產動植物。
行政院農委會保育類野生動物名錄曾於103年7月2日、106年5月1日、108年1月9日調整,珍貴稀有植物於108年4月23日亦有更動。海委會109年4月28日公告修正海洋保育類野生動物名錄。