農委會與海委會公告保育類物種收錄 297 種         
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脊索動物門鳥綱Passeriformes雀形目Paridae山雀科Machlolophus holsti 黃山雀 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Columbiformes鴿形目Columbidae鳩鴿科Macropygia tenuirostris septentrionalis 長尾鳩.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門哺乳綱Pholidota鱗甲目Manidae穿山甲科Manis pentadactyla pentadactyla 穿山甲.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門軟骨魚綱Myliobatiformes鱝目Myliobatidae鱝科Manta alfredi 阿氏前口蝠鱝 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門軟骨魚綱Myliobatiformes鱝目Myliobatidae鱝科Manta birostris 雙吻前口蝠鱝.. 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門哺乳綱Carnivora食肉目Mustelidae貂科Martes flavigula chrysospila 黃喉貂.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Testudines龜鱉目Geoemydidae地龜科Mauremys japonica 日本石龜 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Testudines龜鱉目Geoemydidae地龜科Mauremys mutica 柴棺龜.. 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門爬蟲綱Testudines龜鱉目Geoemydidae地龜科Mauremys reevesii 金龜.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
節肢動物門昆蟲綱Phasmida竹節蟲目Phasmatidae竹節蟲科Megacrania tsudai tsudai 津田氏大頭竹節蟲 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門哺乳綱Cetacea鯨目Balaenopteridae鬚鯨科Megaptera novaeangliae 大翅鯨 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門哺乳綱Cetacea鯨目Ziphiidae喙鯨科Mesoplodon densirostris 柏氏中喙鯨.. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門哺乳綱Cetacea鯨目Ziphiidae喙鯨科Mesoplodon ginkgodens 銀杏齒中喙鯨 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門條鰭魚綱Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科Metzia formosae 臺灣梅氏鯿.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門條鰭魚綱Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科Metzia mesembrinum 大鱗梅氏鯿.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門哺乳綱Rodentia嚙齒目Muridae鼠科Micromys minutus 巢鼠 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門鳥綱Accipitriformes鷹形目Accipitridae鷹科Milvus migrans formosanus 黑鳶(台灣亞種).. 農委會公告珍貴稀有野生動物 
脊索動物門鳥綱Accipitriformes鷹形目Accipitridae鷹科Milvus migrans lineatus 黑鳶(大陸亞種).. 農委會公告瀕臨絕種野生動物 
脊索動物門哺乳綱Carnivora食肉目Mustelidae貂科Mustela nivalis formosana 臺灣小黃鼠狼.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 
脊索動物門鳥綱Passeriformes雀形目Muscicapidae鶲科Myiomela leucura montium 白尾鴝.. 農委會公告其他應予保育之野生動物 

本表說明:農、海委會名錄包括全球範圍,國際物種部分參考華盛頓公約(CITES)第15、16次會員大會最新附錄修正。本表為其中TaiCoL資料庫已收錄的物種,包括依據野生動物保育法公告之陸海域野生保育類、依據文資保存法公告之珍貴稀有植物、依據漁業法公告禁止捕撈販賣及持有之水產動植物。
行政院農委會保育類野生動物名錄曾於103年7月2日、106年5月1日、108年1月9日調整,珍貴稀有植物於108年4月23日亦有更動。海委會109年4月28日公告修正海洋保育類野生動物名錄。