門中文	綱名	綱中文	目名	目中文	科名	科中文	學名	中文名	IUCN	CITES	台灣
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Pholidota	鱗甲目	Manidae	穿山甲科	Manis pentadactyla pentadactyla	穿山甲..
芽孢桿菌門	Bacilli	桿菌綱	Caryophanales	核衣細菌目	Paenibacillaceae	類芽孢桿菌科	Paenibacillus taiwanensis	臺灣類芽孢桿菌..
淡色藻門	Phaeophyceae	褐藻綱	Dictyotales	網地藻目	Dictyotaceae	網地藻科	Homoeostrichus formosana
子囊菌門	Dothideomycetes	座囊菌綱	Mycosphaerellales	球腔菌目	Mycosphaerellaceae	球腔菌科	Pseudocercospora fici-microcarpae
擔子菌門	Dacrymycetes	花耳綱	Dacrymycetales	花耳目	Dacrymycetaceae	花耳科	Calocera bambusicola
擔子菌門	Agaricomycetes	傘菌綱	Polyporales	多孔菌目	Steccherinaceae	齒耳菌科	Steccherinum formosanum	臺灣小薄孔菌..
擔子菌門	Agaricomycetes	傘菌綱	Russulales	紅菇目	Peniophoraceae	隔孢伏革菌科	Peniophora formosana
擔子菌門	Agaricomycetes	傘菌綱	Polyporales	多孔菌目	Meruliaceae	皺皮菌科	Phlebia heterocystidia	異囊射脈菌
苔類植物門	Bryopsida	苔綱	Dicranales	曲尾苔目	Dicranaceae	曲尾苔科	Campylopus taiwanensis	臺灣曲柄苔..
苔類植物門	Andreaeopsida	黑苔綱	Andreaeales	黑苔目	Andreaeaceae	黑苔科	Andreaea taiwanensis	臺灣黑苔..
苔類植物門	Andreaeopsida	黑苔綱	Andreaeales	黑苔目	Andreaeaceae	黑苔科	Andreaea morrisonensis	玉山黑苔
維管束植物門	Lycopodiopsida	石松綱	Isoetales	水韭目	Isoetaceae	水韭科	Isoetes taiwanensis kinmenensis	金門水韭
維管束植物門	Polypodiopsida	水龍骨綱	Polypodiales	水龍骨目	Dryopteridaceae	鱗毛蕨科	Cyrtomium taiwanianum	臺灣貫眾蕨..
維管束植物門	Polypodiopsida	水龍骨綱	Polypodiales	水龍骨目	Dryopteridaceae	鱗毛蕨科	Cyrtomium simadae	尖葉貫眾蕨
維管束植物門	Lycopodiopsida	石松綱	Selaginellales	卷柏目	Selaginellaceae	卷柏科	Selaginella devolii	棣氏卷柏
維管束植物門	Polypodiopsida	水龍骨綱	Polypodiales	水龍骨目	Dryopteridaceae	鱗毛蕨科	Polystichum parvipinnulum	尖葉耳蕨
維管束植物門	Polypodiopsida	水龍骨綱	Polypodiales	水龍骨目	Dryopteridaceae	鱗毛蕨科	Polystichum pseudostenophyllum	擬芽孢耳蕨
維管束植物門	Polypodiopsida	水龍骨綱	Polypodiales	水龍骨目	Dryopteridaceae	鱗毛蕨科	Polystichum integripinnum	狹葉貫眾蕨
維管束植物門	Polypodiopsida	水龍骨綱	Polypodiales	水龍骨目	Dryopteridaceae	鱗毛蕨科	Polystichum taizhongense	臺中耳蕨..
維管束植物門	Polypodiopsida	水龍骨綱	Polypodiales	水龍骨目	Dryopteridaceae	鱗毛蕨科	Polystichum × gemmilachenense	芽孢高山耳蕨