門中文	綱名	綱中文	目名	目中文	科名	科中文	學名	中文名	IUCN	CITES	台灣
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Artiodactyla	偶蹄目	Cervidae	鹿科	Rusa unicolor swinhoii	臺灣水鹿..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Lagomorpha	兔形目	Leporidae	兔科	Lepus sinensis formosus	臺灣野兔..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Rodentia	嚙齒目	Cricetidae	倉鼠科	Microtus kikuchii	臺灣高山田鼠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Rodentia	嚙齒目	Sciuridae	松鼠科	Belomys pearsonii kaleensis	小鼯鼠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Rodentia	嚙齒目	Sciuridae	松鼠科	Callosciurus erythraeus thaiwanensis	赤腹松鼠
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Rodentia	嚙齒目	Sciuridae	松鼠科	Dremomys pernyi owstoni	長吻松鼠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Rodentia	嚙齒目	Sciuridae	松鼠科	Petaurista alborufus lena	白面鼯鼠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Rodentia	嚙齒目	Sciuridae	松鼠科	Petaurista philippensis grandis	大赤鼯鼠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Rodentia	嚙齒目	Sciuridae	松鼠科	Tamiops maritimus formosanus	條紋松鼠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Rodentia	嚙齒目	Muridae	鼠科	Apodemus semotus	臺灣森鼠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Rodentia	嚙齒目	Muridae	鼠科	Niviventer coninga	臺灣刺鼠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Rodentia	嚙齒目	Muridae	鼠科	Niviventer culturatus	高山白腹鼠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Pteropodidae	狐蝠科	Pteropus dasymallus formosus	臺灣狐蝠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Hipposideridae	葉鼻蝠科	Coelops frithii formosanus	臺灣無尾葉鼻蝠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Hipposideridae	葉鼻蝠科	Hipposideros armiger terasensis	臺灣葉鼻蝠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Vespertilionidae	蝙蝠科	Arielulus torquatus	黃頸蝠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Vespertilionidae	蝙蝠科	Eptesicus pachyomus horikawai	堀川氏棕蝠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Vespertilionidae	蝙蝠科	Murina bicolor	黃胸管鼻蝠
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Vespertilionidae	蝙蝠科	Murina gracilis	姬管鼻蝠
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Vespertilionidae	蝙蝠科	Murina puta	臺灣管鼻蝠..