門中文	綱名	綱中文	目名	目中文	科名	科中文	學名	中文名	IUCN	CITES	台灣
維管束植物門	Magnoliopsida	木蘭綱	Asparagales	天門冬目	Orchidaceae	蘭科	Appendicula reflexa	臺灣竹節蘭..
維管束植物門	Magnoliopsida	木蘭綱	Asparagales	天門冬目	Orchidaceae	蘭科	Appendicula reflexa kotoensis	蘭嶼竹葉蘭
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Trichoptera	毛翅目	Hydrobiosidae	囊翅石蛾科	Apsilochorema excisum	凹翅白條石蛾
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Coleoptera	鞘翅目	Chrysomelidae	金花蟲科	Apterogaleruca hirtihumeralis	條背缺翅螢金花蟲
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Coleoptera	鞘翅目	Chrysomelidae	金花蟲科	Apterogaleruca uenoi	上野缺翅螢金花蟲
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Dermaptera	革翅目	Forficulidae	蠼螋科	Apterygida tuberculosa	無翅小瘤螋
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Dermaptera	革翅目	Forficulidae	蠼螋科	Apterygida tumida	無翅胖螋
脊索動物門	Aves	鳥綱	Apodiformes	雨燕目	Apodidae	雨燕科	Apus nipalensis kuntzi	小雨燕..
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Coleoptera	鞘翅目	Lampyridae	螢科	Aquatica hydrophila	黃胸黑翅螢
維管束植物門	Magnoliopsida	木蘭綱	Brassicales	十字花目	Brassicaceae	十字花科	Arabis formosana	臺灣筷子芥..
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Lepidoptera	鱗翅目	Zygaenidae	斑蛾科	Arachotia hohuanshanensis	合歡山亮腹狹翅斑蛾
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Lepidoptera	鱗翅目	Geometridae	尺蛾科	Aracima serrata	單線灰黃尺蛾
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Hemiptera	半翅目	Aradidae	扁蝽科	Aradus smetanai
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Coleoptera	鞘翅目	Anthribidae	長角象鼻蟲科	Araecerus siliquae
脊索動物門	Aves	鳥綱	Galliformes	雞形目	Phasianidae	雉科	Arborophila crudigularis	臺灣山鷓鴣..
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Lepidoptera	鱗翅目	Zygaenidae	斑蛾科	Arbudas bilushenmu	碧綠紅頸斑蛾
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Lepidoptera	鱗翅目	Zygaenidae	斑蛾科	Arbudas submacula	黃紋紅頸斑蛾..
軟體動物門	Bivalvia	雙殼綱	Arcida	魁蛤目	Arcidae	魁蛤科	Arca taiwanensis	臺灣魁蛤..
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Coleoptera	鞘翅目	Curculionidae	象鼻蟲科	Archarius anneae
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Coleoptera	鞘翅目	Curculionidae	象鼻蟲科	Archarius hirokoae