門中文	綱名	綱中文	目名	目中文	科名	科中文	學名	中文名	IUCN	CITES	台灣
軟體動物門	Cephalopoda	頭足綱	Nautiloida	鸚鵡螺目	Nautilidae	鸚鵡螺科	Nautilus taiwanus	臺灣鸚鵡螺..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Artiodactyla	偶蹄目	Cervidae	鹿科	Cervus nippon taiouanus	臺灣梅花鹿..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Artiodactyla	偶蹄目	Cervidae	鹿科	Muntiacus reevesi micrurus	臺灣山羌..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Artiodactyla	偶蹄目	Cervidae	鹿科	Rusa unicolor swinhoii	臺灣水鹿..
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Hemiptera	半翅目	Calophyidae	麗木蝨科	Calophya evodiae	茱萸麗木蝨
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Hemiptera	半翅目	Calophyidae	麗木蝨科	Calophya meliorata	美優麗木蝨
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Hemiptera	半翅目	Calophyidae	麗木蝨科	Calophya triangula	三角麗木蝨
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Hemiptera	半翅目	Calophyidae	麗木蝨科	Cecidopsylla cata	木荷癭木蝨
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Hemiptera	半翅目	Calophyidae	麗木蝨科	Cecidopsylla spinosa	雄刺癭木蝨
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Hemiptera	半翅目	Calophyidae	麗木蝨科	Strogylocephala confluens	完顏木蝨
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Hemiptera	半翅目	Calophyidae	麗木蝨科	Synpsylla wendlandiae	梨斑興木蝨
維管束植物門	Magnoliopsida	木蘭綱	Buxales	黃楊目	Buxaceae	黃楊科	Buxus microphylla tarokoensis	太魯閣黃楊
脊索動物門	Reptilia	爬蟲綱	Squamata	有鱗目	Colubridae	黃頷蛇科	Hebius miyajimae	金絲蛇..
脊索動物門	Reptilia	爬蟲綱	Squamata	有鱗目	Colubridae	黃頷蛇科	Hebius sauteri	梭德氏游蛇..
脊索動物門	Reptilia	爬蟲綱	Squamata	有鱗目	Colubridae	黃頷蛇科	Orthriophis taeniurus friesi	臺灣黑眉錦蛇..
脊索動物門	Reptilia	爬蟲綱	Squamata	有鱗目	Colubridae	黃頷蛇科	Psammodynastes pulverulentus papenfussi	茶斑蛇..
脊索動物門	Reptilia	爬蟲綱	Squamata	有鱗目	Colubridae	黃頷蛇科	Rhabdophis swinhonis	斯文豪氏游蛇..
脊索動物門	Aves	鳥綱	Passeriformes	雀形目	Oriolidae	黃鸝科	Oriolus traillii ardens	朱鸝
軟體動物門	Gastropoda	腹足綱	Stylommatophora	柄眼目	Philomycidae	黏液蛞蝓科	Meghimatium baoshanense	寶山蛞蝓
節肢動物門	Insecta	昆蟲綱	Psocodea	嚙蟲目	Philotarsidae	黑斑嚙蟲科	Aaroniella serialis	毛列阿嚙蟲