臺灣特有生物 9825 種(亞種變種)               
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刺胞動物門Hexacorallia六放珊瑚綱Scleractinia石珊瑚目Fungiidae蕈珊瑚科Fungia (Pleuractis) taiwanensis 臺灣蕈珊瑚..  華盛頓公約附錄2  
脊索動物門Mammalia哺乳綱Primates靈長目Cercopithecidae獼猴科Macaca cyclopis 臺灣獼猴..  華盛頓公約附錄2  
脊索動物門Aves鳥綱Passeriformes雀形目Leiothrichidae噪眉科Garrulax taewanus 臺灣畫眉..  華盛頓公約附錄2  
脊索動物門Aves鳥綱Galliformes雞形目Phasianidae雉科Syrmaticus mikado 黑長尾雉..  華盛頓公約附錄1  
脊索動物門Aves鳥綱Galliformes雞形目Phasianidae雉科Lophura swinhoii 藍腹鷴..  華盛頓公約附錄1  
擬桿菌門Flavobacteria黃桿菌綱Flavobacteriales黃桿菌目Flavobacteriaceae黃桿菌科Chryseobacterium taiwanense 臺灣金黃桿..    
厚壁菌門Bacilli桿菌綱Bacillales芽孢桿菌目Paenibacillaceae類芽孢桿菌科Paenibacillus taiwanensis 臺灣類芽孢桿菌..    
褐藻門Phaeophyceae褐藻綱Dictyotales網地藻目Dictyotaceae網地藻科Homoeostrichus formosana     
子囊菌門Dothideomycetes座囊菌綱Mycosphaerellales球腔菌目Mycosphaerellaceae球腔菌科Pseudocercospora fici-microcarpae     
擔子菌門Basidiomycetes擔子菌綱Dacrymycetales花耳目Dacrymycetaceae花耳科Calocera bambusicola     
擔子菌門Agaricomycetes傘菌綱Polyporales多孔菌目Steccherinaceae齒耳菌科Steccherinum formosanum 臺灣小薄孔菌..    
擔子菌門Agaricomycetes傘菌綱Russulales紅菇目Peniophoraceae隔孢伏革菌科Peniophora formosana     
擔子菌門Agaricomycetes傘菌綱Polyporales多孔菌目Meruliaceae皺皮菌科Phlebia heterocystidia 異囊射脈菌    
苔類植物門Bryopsida苔綱Dicranales曲尾苔目Dicranaceae曲尾苔科Campylopus taiwanensis 臺灣曲柄苔..    
苔類植物門Andreaeopsida黑苔綱Andreaeales黑苔目Andreaeaceae黑苔科Andreaea taiwanensis 臺灣黑苔..    
苔類植物門Andreaeopsida黑苔綱Andreaeales黑苔目Andreaeaceae黑苔科Andreaea morrisonensis 玉山黑苔    
維管束植物門Lycopodiopsida石松綱Isoetales水韭目Isoetaceae水韭科Isoetes taiwanensis kinmenensis 金門水韭    
維管束植物門Lycopodiopsida石松綱Isoetales水韭目Isoetaceae水韭科Isoetes taiwanensis taiwanensis 臺灣水韭..    
維管束植物門Polypodiopsida水龍骨綱Polypodiales水龍骨目Dryopteridaceae鱗毛蕨科Cyrtomium taiwanianum 臺灣貫眾蕨..    
維管束植物門Polypodiopsida水龍骨綱Polypodiales水龍骨目Dryopteridaceae鱗毛蕨科Cyrtomium simadae 尖葉貫眾蕨