門中文	綱名	綱中文	目名	目中文	科名	科中文	學名	中文名	IUCN	CITES	台灣
脊索動物門	Actinopterygii	條鰭魚綱	Cypriniformes	鯉形目	Cyprinidae	鯉科	Squalidus banarescui	巴氏銀鮈..
脊索動物門	Actinopterygii	條鰭魚綱	Salmoniformes	鮭形目	Salmonidae	鮭科	Oncorhynchus masou formosanus	臺灣櫻花鉤吻鮭..
脊索動物門	Amphibia	兩生綱	Caudata	有尾目	Hynobiidae	山椒魚科	Hynobius sonani	楚南氏山椒魚..
脊索動物門	Amphibia	兩生綱	Caudata	有尾目	Hynobiidae	山椒魚科	Hynobius formosanus	臺灣山椒魚..
脊索動物門	Amphibia	兩生綱	Caudata	有尾目	Hynobiidae	山椒魚科	Hynobius fucus	觀霧山椒魚..
脊索動物門	Amphibia	兩生綱	Caudata	有尾目	Hynobiidae	山椒魚科	Hynobius glacialis	南湖山椒魚..
脊索動物門	Aves	鳥綱	Strigiformes	鴞形目	Tytonidae	草鴞科	Tyto longimembris pithecops	草鴞..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Carnivora	食肉目	Ursidae	熊科	Ursus thibetanus formosanus	臺灣黑熊..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Carnivora	食肉目	Felidae	貓科	Neofelis nebulosa brachyura	臺灣雲豹..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Pteropodidae	狐蝠科	Pteropus dasymallus formosus	臺灣狐蝠..
脊索動物門	Reptilia	爬蟲綱	Squamata	有鱗目	Colubridae	黃頷蛇科	Hebius miyajimae	金絲蛇..
維管束植物門	Pinopsida	松綱	Cupressales	柏目	Taxaceae	紅豆杉科	Amentotaxus formosana	臺灣穗花杉..
維管束植物門	Pinopsida	松綱	Cupressales	柏目	Cupressaceae	柏科	Juniperus chinensis taiwanensis	清水圓柏..
維管束植物門	Magnoliopsida	木蘭綱	Myrtales	桃金孃目	Onagraceae	柳葉菜科	Epilobium nankotaizanense	南湖柳葉菜
芽孢桿菌門	Bacilli	桿菌綱	Caryophanales	核衣細菌目	Paenibacillaceae	類芽孢桿菌科	Paenibacillus taiwanensis	臺灣類芽孢桿菌..
淡色藻門	Phaeophyceae	褐藻綱	Dictyotales	網地藻目	Dictyotaceae	網地藻科	Homoeostrichus formosana
子囊菌門	Dothideomycetes	座囊菌綱	Mycosphaerellales	球腔菌目	Mycosphaerellaceae	球腔菌科	Pseudocercospora fici-microcarpae
擔子菌門	Dacrymycetes	花耳綱	Dacrymycetales	花耳目	Dacrymycetaceae	花耳科	Calocera bambusicola
擔子菌門	Agaricomycetes	傘菌綱	Polyporales	多孔菌目	Steccherinaceae	齒耳菌科	Steccherinum formosanum	臺灣小薄孔菌..
擔子菌門	Agaricomycetes	傘菌綱	Russulales	紅菇目	Peniophoraceae	隔孢伏革菌科	Peniophora formosana