門中文	綱名	綱中文	目名	目中文	科名	科中文	學名		中文名
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Hipposideridae	葉鼻蝠科	Coelops frithii formosanus		臺灣無尾葉鼻蝠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Hipposideridae	葉鼻蝠科	Hipposideros armiger terasensis		臺灣葉鼻蝠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Miniopteridae	長翼蝠科	Miniopterus fuliginosus		東亞摺翅蝠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Molossidae	游離尾蝠科	Tadarida insignis		東亞游離尾蝠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Pteropodidae	狐蝠科	Cynopterus sphinx		印度犬果蝠
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Pteropodidae	狐蝠科	Pteropus dasymallus formosus		臺灣狐蝠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Pteropodidae	狐蝠科	Rousettus leschenaultii		棕果蝠
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Rhinolophidae	蹄鼻蝠科	Rhinolophus formosae		臺灣大蹄鼻蝠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Rhinolophidae	蹄鼻蝠科	Rhinolophus monoceros		臺灣小蹄鼻蝠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Vespertilionidae	蝙蝠科	Arielulus torquatus		黃頸蝠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Vespertilionidae	蝙蝠科	Barbastella darjelingensis		東方寬耳蝠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Vespertilionidae	蝙蝠科	Eptesicus pachyomus horikawai		堀川氏棕蝠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Vespertilionidae	蝙蝠科	Harpiocephalus harpia		毛翼管鼻蝠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Vespertilionidae	蝙蝠科	Harpiola isodon		金芒管鼻蝠
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Vespertilionidae	蝙蝠科	Hypsugo pulveratus		灰伏翼
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Vespertilionidae	蝙蝠科	Kerivoula furva		玄彩蝠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Vespertilionidae	蝙蝠科	Murina bicolor		黃胸管鼻蝠
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Vespertilionidae	蝙蝠科	Murina gracilis		姬管鼻蝠
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Vespertilionidae	蝙蝠科	Murina puta		臺灣管鼻蝠..
脊索動物門	Mammalia	哺乳綱	Chiroptera	翼手目	Vespertilionidae	蝙蝠科	Murina recondita		隱姬管鼻蝠